Anaïs Brosse, Ill. Joséphine Joffrin, Edp Sciences
Le grand public entend beaucoup parler de microbiote sans savoir exactement ce que recouvre ce terme scientifique. Anaïs Brosse, enseignante chercheuse à l’Université de Paris-Saclay, spécialisée dans les interactions hôtes-pathogènes, fait preuve d’une grande qualité de médiation scientifique, en prenant l’exemple d’une famille dont les membres découvrent que des micro-organismes occupent leurs intestins. Ces informations sont rendues super accessibles par les dessins, en particulier les schémas, de Joséphine Joffrin, illustratrice scientifique. De plus, les termes scientifiques sont définis par un glossaire en fin d’ouvrage. Qu’est-ce qu’un microbiote ? « Le microbiote désigne un ensemble de micro-organismes dans un environnement donné ». Le microbiome décrit ces micro-organismes et les gènes présents dans les chromosomes. Les cellules sont classées suivant différents niveaux hiérarchiques. Il y a aussi dans le microbiote des embranchements divisés en plusieurs genres à leur tour divisés en espèces. En comparant des bactéries, la construction d’arbres phylogénétique, il est possible de dire si « une bactérie possède des facteurs de virulence ». Ce classement est appelé « taxonomie ». Comment part-on à la recherche des bactéries dans le microbiote ? Une technique, celle du séquençage de l’ADNr-16S a révolutionné l’exploration. Comment colonisent-elles le tube digestif ? Les bactéries aérobies tolérant l’oxygène sont présentes dans l’estomac. Les bactéries anaérobies peuplent le colon. Une grande illustration de l’épithélium intestinal permet de visualiser les villosités, les cryptes et les microvillosités. Le mucus intestinal comprend deux couches dont la couche externe colonisé par certaines bactéries. Basile est affolé car les bactéries qu’il a vues en rêve ont envahi son intestin suite à une altération de la couche du mucus. Elles sont des milliards ! La « métagénomique » est une méthode d’étude des microbiotes. Il est expliqué de manière claire comment on extrait l’ADN des bactéries. « L’analyse des séquences définit la liste des bactéries présentes dans l’échantillon. Quels sont les rôles et les super-pouvoirs de notre microbiote ? « Une cohabitation productive ». C’est une relation de « commensalisme » c’est-à-dire bénéfique pour les deux. Les bactéries peuvent subvenir jusqu’à 10% de nos besoins en énergie. Les bactéries « symbiotes » jouent un rôle de barrière. Flore, la maman tombe malade. Quelles sont ses défenses immunitaires ? Savez-vous que les cellules « dendritiques » activent la production de cellules immunitaires ? Des bactéries commensales limitent l’inflammation. Comment se passe l’axe intestin-cerveau ? Les « métabolites » bactériens communiquent avec le cerveau par la circulation sanguine. De ce fait, quand le microbiote est déséquilibré, l’humeur, la faim… peuvent être perturbés. Des événements au cour de la vie peuvent perturber le microbiote. Super illustration montrant flore en train de regarder sa collection de micro-organismes : un microbiote équilibré est qualifié d’ « eubiose ». Par contre quand il est déséquilibré, il est en « dysbiose » et les pathogènes peuvent proliférer. La question proposée est de savoir si suite à une césarienne, le bébé ne souffrira pas, par la suite , de maladies ? Il en est de même lorsqu’on modifie nos habitudes alimentaires ou quand on prend des antibiotiques, des pathologies peuvent se déclarer. En cas d’infection à Clistrioides, une transplantation fécale est une solution innovante. Les probiotiques favorisent la restauration des microbiotes. De nombreuses recherches sont à venir au sujet des probiotiques. Dans cet excellent documentaire aux dessins scientifiques originaux, l’exploration du microbiote intestinal permet de connaitre comment il fonctionne et ainsi de faire de bons choix pour qu’il soit équilibré. Les découvertes scientifiques sont très prometteuses dans l’avenir pour guérir différentes pathologies et aussi préserver notre environnement.
